Aunque el juego nos permite realizar estas misiones de forma automtica, tenemos muchsimos retos por delante que necesitarn de nuestra habilidad. Es por ello que el control del juego est perfectamente adaptado a dispositivos mviles: nos moveremos con el stick virtual izquierdo, mientras que a la derecha de la pantalla estn los diferentes botones para atacar y desatar nuestras habilidades de ninjutsu.