Mrt.exe Herramienta De Eliminación De Software Malintencionado De Microsoft Windows

Buenas tardes. Acabo de activar mediante cmd. Me indica que ya est activado, pero inmediatamente me ha saltado el antivirus diciendo que es una amenaza grave y lo ha puesto en cuarentena. Realmente hay algn problema con estos comandos?
Gracias por su ayuda.