All, tras superar varias pruebas, logran acceder a la ubicacin de Cortex para enfrentarlo. El doctor, sin embargo, tena un truco bajo la manga. Bebe una de las pcimas de mutgeno de N.Brio, y se convierte en un mutante, para aniquilar a Crash de una vez por todas. Crash, con la ayuda del Grimly, lo derrota y lo domina, y finalmente lo vence. Cortex, molesto por haber perdido contra Crash otra vez, hace un berrinche que accidentalmente termina daando la estacin, provocando que esta se dirija en curso de colisin contra la tierra. Cortex logra escapar junto a un Linterno en una cpsula, pero Crash y Aku Aku se quedan en la nave cuando esta choca, y aun as sobreviven. Luego de la derrota de Cortex, se reencuentran con Coco y Crunch, y as los Bandicoots logran alcanzar una vida pacfica una vez ms, libres ahora de los planes del Dr. Cortex y de su dispositivo NUV. As, la historia termina.