A fluorescncia a absoro da energia luminosa e sua transformao em luz de emisso, junto com energia cintica e calor. Uma vez que a luz emitida mais baixa em energia do que a luz de entrada, a emisso sempre de maior comprimento de onda. O processo de absoro de energia, converso de energia e emisso de luz rpido e ocorre em um intervalo de nanossegundos. Portanto, a deteco da intensidade de fluorescncia ocorre da seguinte forma em um leitor de placas: excitao com luz em um comprimento de onda especfico e deteco da emisso de luz em comprimento de onda mais alto aproximadamente ao mesmo tempo. A seleo do comprimento de onda realizada atravs de filtros ou monocromadores. A intensidade da fluorescncia proporcional em relao concentrao de um fluorforo e , portanto, usada para quantificar molculas fluorescentes (ou marcadas com fluorescncia). Outras aplicaes de intensidade de fluorescncia empregam uma mudana na emisso de fluorescncia ou um aumento de fluorescncia ao interagir com uma molcula de interesse para detectar uma molcula especfica. As aplicaes tpicas de fluorescncia detectadas por um leitor de placa de fluorescncia so as seguintes: