Dependiendo de la aplicacin Java utilizada, esta usar el listado / repositorio de certificados de confianza de la propia mquina virtual JVM o bien usar un keystore propio, tambin en formato JKS. Naturalmente es posible arrancar la JVM especificando un trustStore concreto y no el predeterminado de la mquina virtual Java instalada, algo til a la hora de hacer pruebas.