en el disco duro tiene que estar una carpeta llamada apps, en esa carpeta colocas las aplicaciones de el homebrew, por ejemplo, al descomprimir un emulador te viene una carpeta con el nombre del emulador y una carpeta de apps, tienes que abrir la carpeta que descomprimiste y ahi va haber otra carpeta con el nombre del emulador, esa carpeta la vas a colocar en la carpeta apps en el disco duro y la otra carpeta (la carpeta que dice el nombre del emulador, la que no esta en la carpeta apps) la colocas en la raiz de el usb