Hola, respondiendo a tu pregunta la verdad desconozco si se pueda configurar la salida a lnea de comandos en vez de su pantalla predeterminada de salida, lo que puedes hacer si quieres correr tu programa desde la lnea de comandos es ir a la carpeta donde tienes guardados tus proyectos localizar el de tu inters y dentro buscar la carpeta build ah busca el ejecutable de tu archivo y ejectalo en MSDOS.
Saludos espero haber sido de ayuda.