Antes de ejecutar chkdsk /r, es aconsejable hacer una copia de seguridad de los archivos importantes en otra unidad de almacenamiento, ya que podran eliminarse una vez finalizado el proceso. Existe una pequea posibilidad de que, si estos archivos se encuentran cerca de un sector defectuoso, chkdsk /r los identifique como daados y se deshaga de ellos.