Vers, el formato que nos devuelve canvas.toDataURL no es directamente base64 si no una URI en formato base64, el cul es legible directamente por una etiqueta img siempre y cuando tenga el formato adecuado, as que lo nico que debes hacer para que la imagen sea descargable es, a esta nueva data obtenida como base64 cargarla en un elemento img, y una vez cargada la data puedes setear el atributo download en ella para que sea descargable al darle click, donde tu nuevo string en base64 se ver algo parecido a esto: