Posteriormente, en 2002, llegaron Pokmon Rub y Zafiro, que fueron los primeros en estrenar la tercera generacin. Estos nuevos juegos se caracterizan por ser las primeras ediciones de Pokmon para la Game Boy Advance. De esta forma, estos cuentan con una calidad grfica superior con respecto a sus predecesores. Adems, se aaden 135 nuevas especies y una nueva regin, Hoenn.