Si un documento PDF viene protegido con una contrasea, necesitars esa contrasea para abrir ese archivo PDF en cualquier herramienta. Si no tienes la contrasea, es imposible abrir ese PDF en cualquier software, por lo que exportarlo tambin ser imposible. Cuando tengas la contrasea de esos documentos, puedes exportarlos usando UPDF yendo a "Exportar PDF", seleccionando el formato deseado y exportando.