Una vez que se han definido todos los requisitos se debe decidir cules son las herramientas de software adecuadas para permitir la creacin de las referencias cruzadas. stas dependen de la complejidad de las referencias cruzadas y del proceso para su generacin. Las tres opciones principales incluyen el uso de herramientas multipropsito simples como Excel, aplicaciones exclusivas de mantenimiento de referencias cruzadas y/o aplicaciones personalizadas incorporadas.