El juego estar ambientado entre las historia de las dos partes de Half-Life. Alyx Vance y su padre, Eli, sern los protagonistas que liderarn la lucha de la resistencia contra la Alianza (The Combine), los invasores de la Tierra. Las mecnicas mantendrn el espritu de los originales, mezclando exploracin, combate e ingeniosos puzzles sobre un argumento slido y repleto de sorpresas.