El sistema de archivos exFAT es una versin moderna y tcnicamente mejorada del clsico sistema de archivos FAT, por lo que es tambin mejor que FAT32. Las diferencias radican, principalmente, en la ampliacin del tamao de los archivos y de la particin y en la mejora de la compatibilidad. Frente a NTFS, la cosa cambia, ya que este ltimo es el sistema de archivos estndar de Microsoft.